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雙峰駝和單峰駝的基因序列

瀏覽: ?? 時間:2021-03-06 16:24

摘要:雙峰駝是中國和蒙古寒冷沙漠地區(qū)的重要交通工具。在這篇文章中雙峰駝基因組測序與分析聯(lián)盟提出了一個2.01gb的野生和家養(yǎng)雙峰駝基因組序列草案。并估計駱駝基因組為2.38gb,包含2

雙峰駝是中國和蒙古寒冷沙漠地區(qū)的重要交通工具。在這篇文章中雙峰駝基因組測序與分析聯(lián)盟提出了一個2.01gb的野生和家養(yǎng)雙峰駝基因組序列草案。并估計駱駝基因組為2.38gb,包含20821個蛋白質(zhì)編碼基因。

(駝可汗駱駝奶招商加盟) 這個聯(lián)盟的系統(tǒng)基因組學(xué)分析顯示,大約5500-6000萬年前,駱駝與其他有蹄類動物有著共同的祖先。駱駝血統(tǒng)中快速進化的基因在代謝途徑中顯著豐富,這些變化可能是這些動物典型的胰島素抵抗的基礎(chǔ)。估計野生和家養(yǎng)駱駝的全基因組雜合度為1.0×10-3。然而,在家養(yǎng)駱駝中發(fā)現(xiàn)了雜合度明顯較低的基因組區(qū)域,這些區(qū)域的嗅覺受體豐富。聯(lián)盟的比較基因組學(xué)分析也可能揭示駱駝顯著的耐鹽性和不尋常的免疫系統(tǒng)的遺傳基礎(chǔ)。

(駝可汗駱駝奶招商加盟) 圖1雙峰駝與其他動物的基因組比較 (a)雙峰駝和動物在脊椎動物(雞和斑馬魚;NCBI基因組登錄碼GCF_000002315.3 and GCF_000002035.4)、哺乳動物(人、黑猩猩、小鼠和大鼠;NCBI基因組登錄碼GCF_000001405.21, GCF_000001515.5, GCF_000001635.20 and GCF_000001895.4)中共享的直系生物比例,Laurasiatheria(狗和馬;NCBI基因組登錄碼GCF_000002285.3 and GCF_000002305.2)和Artiodactyla(牛和豬;NCBI基因組登錄碼GCF_000003055.4 and GCF_000003025.5)。

(駝可汗駱駝奶招商加盟) (b)每個支架上的共通區(qū)長度(Mb,百萬堿基對)。覆蓋率的計算方法是將共濟區(qū)的長度除以支架的長度。覆蓋率分別為>75%、>50%和<50%的腳手架用紅點、綠點和灰點表示。

(c)九種哺乳動物的超樹推理。拓撲由輸入樹引導(dǎo)百分比計算。距離以百萬年為單位顯示。 (d)通過KEGG路徑,點代表駱駝和牛dN/dS比率的中間對。快速進化的基因在駱駝和牛中顯著富集(FDRo0.05)的途徑分別被染成紅色和綠色。MAPK,絲裂原活化蛋白激酶;mTOR,雷帕霉素的哺乳動物靶點;TCA,三羧酸循環(huán)

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